شورا متشکل از افراد باسابقه فعالیت مدنی است که طی این سال ها تجارب موفق و ناموفق بسیاری را پشت سر گذاشته اند. ایشان پس از گفتگوهای بسیار زیاد، بر روی کارکردها و مأموریت زیر در شورای هماهنگی سازمان های جامعه مدنی ایران توافق و اجماع کردند. فلسفه پیدایش و حیات شورا و مأموریت ذاتی آن عبارت است از :
دیده بانی حقوق جامعه مدنی و پشتیبانی، فرهنگ سازی و توانمندسازی سازمان های جامعه مدنی ایران
شورای مرکزی و همه ارکان اجرایی و مشورتی شورا موظفند بر اساس این چارچوب فعالیت های شورا را تنظیم و به پیش برند.